问题：有些业务有没税务风险，比如，我们分公司开展业务成本支出，发票抬头开，分公司，但是成本通过列账放在本部，发票在分公司。或者是，发票抬头开分公司，成本还在本部，我们是汇总申报所得税的，分公司是独立的纳税主体。

答：《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》（国家税务总局公告2012年第57号）第四条规定，总机构和具有主体生产经营职能的二级分支机构，就地分摊缴纳企业所得税。

二级分支机构，是指汇总纳税企业依法设立并领取非法人营业执照（登记证书），且总机构对其财务、业务、人员等直接进行统一核算和管理的分支机构。

据此，独立核算的分公司，应为企业所得税纳税人。由此，总公司将独立核算分公司发票作为成本费用，不予税前扣除。